A ver para correr el emulador de PS2 necesitas mínimo un Core 2 Duo de 3.2GHz (generación "antigua") o un Core i3, i5, i7 de al menos 2.8GHz, los cuales son procesadores mas nuevos y modernos.
Los Core 2 Duo son mas baratos, los i3, i5, i7 son mas caros.
Cómo dice BALLE- un Quad-Core también iría perfecto.
De RAM yo diría que mínimo 3gb... A la segura con 4gb o mas. Aquí tienes muchas opciones, DDR2 o 3, Con mas frecuencia o menos, dual channel o single channel. Todo depende de tu presupuesto.
Una tarjeta de vídeo buena que soporte los DirectX nuevos (10-11), según la pagina sobre una 8800gt debería ir.
Con eso debería andar perfecto ! sumando una fuente de poder decente (unos 650w falsos - 450 reales) mas la placa madre y los discos duros.
Usado de seguro te sale mas barato, pero no sabría decirte cuanto vale allá
Si tienes discos duros SATA, te fijas que la placa madre tenga los conectores que necesites y la fuente de poder igual
Para los IDE te fijas que la placa tenga los conectores (cuidado con confundirlos con los de disquetera) y la fuente de poder tenga molex libres.
Otra cosa que tienes que tener muy en cuenta es que algunas placas madres antiguas no te van a tomar 2 tb de disco duro! mucho ojo con eso !
Un saludo