como proteger inicio de RetrOs?, he visto que RetrOs tiene esa opcion!

Hola zoneros! les vengo con una duda, pero primero os planteo mi problema:

Hace unos dias, me puse a mejorar mi maca, cambie memoria, disco (antes ide, ahora sata) y coloque una placa de video que andaban sobrando por ahi..
el tema es que quise usar el ClrMamepro y ahi la cague...no se que paso, pero cuando quise rebootear mi maca, no arranco mas...
Tuve que reinstalar RetrOs, y volver a bajar todo el RomSet...una desgracia...tardo todo el fin de seemana en bajar, pero cuando lo reinstale, lei que tiene la opcion de "congelar" el disco rigido, para que no se altere el arranque, y nunca falle. Vi que se puede hacer en una tarjeta flash, pero yo he ido un poco mas (o un poco menos): hice una particion en mi disco de 4Gb para el RetrOs, y el resto va a ir al D: que es la otra particion.
Ahora, quiero saber como hacer para que mi C: quede congelado y nunca mas se me desconfigure. con ese sistema de congelamiento, se puede hacer?
Desde ya les agradezco infinitamente su ayuda!

Pablo